中国科学院上海高等研究院（筹）在筹建初期就设立了国际合作处，目的是加强高研院整体国际合作工作的服务、协调、引导和监督。国际合作处是高研院涉外事务管理部门，同时也是对外交流的窗口，负责高研院外事相关的一切事务。主要职责包括：制订国际交流和外事工作规章制度；积极与国外知名企业、大学和研究机构等开展国际合作项目，探索国际合作创新模式；加强与科学院层面和相关部委、地方政府涉外部门的联系，积极争取各类国际合作与交流项目、计划等资源；为因公出国（境）人员办理审核、报批、护照、签证等涉外事务；主办、承办各类国际会议；来访外宾的接待工作以及英文网站建设等。