9月25日至10月1日，中国科学院副院长张亚平率团访问了澳大利亚和阿根廷，出席并主持了中科院与澳联邦科工业组织（CSIRO）第四届联合指导委员会会议，与澳昆士兰州政府续签了合作意向书。他还前往阿根廷参加了发展中国家科学院（TWAS）大会的部分活动，并作为TWAS生物奖评奖委员会主席主持了该委员会会议。 

　　9月26-27日，张亚平与CSIRO副总裁Craig Roy在墨尔本共同主持了CAS-CSIRO第四届联委会会议。双方评估了前几年联合支持的项目，就2013-2014年度合作计划达成了共识并签署了联合声明。双方同意在可持续农业与作物育种、气候变化的影响、纳米技术与能源新材料、健康科学这四个领域择优支持4个新的合作项目，并同意共同支持多个领域的专题合作研讨会。双方还就科研机构的国际化战略、知识产权、双方合作的优先领域、联委会及评审专家的工作原则等问题进行了深入的讨论。会议期间，CSIRO总裁Megan Clark女士、澳科技部副部长Patricia Kelly女士、澳科院院长Suzanne Cory女士会见了张亚平一行。 

　　9月28日，张亚平在布里斯班与澳昆士兰州政府科学、信息技术、创新和艺术部长Ian Walker共同签署了《中国科学院与昆士兰州科技合作计划》，双方承诺在未来两年继续共同支持能源、健康、医疗和农业生物技术领域的合作研究项目。张亚平还参观了昆士兰大学新建的转化医学研究所（Translational Research Institute），并与Walker部长就中科院与昆州科技合作等共同关心的问题进行了讨论。 

    结束在澳大利亚的访问之后，张亚平赴阿根廷布宜诺斯艾利斯出席了发展中国家科学院第二十四届大会，并作为TWAS生物奖评奖委员会主席主持了该委员会会议。经过讨论，会议评选出2013年TWAS生物奖获奖人两名：中国科学院上海生命科学研究院徐国良研究员和中国台湾中央研究院分子生物学研究所林淑端（LIN-CHAO Sue Duan）研究员（女）。