由中科院和中研院共同发起主办的“第二届海峡两岸生命科学论坛”于2014年12月1日-2日在台北举行。中科院副院长张亚平院士和中研院副院长陈建仁共同担任大会主席并做大会报告，中研院院长翁启惠出席了开幕式并致辞。张亚平副院长在开幕式致辞中指出，生命科学论坛的举办得到了两岸生命科学领域专家学者的大力支持，应长期、稳定、轮流地举办下去，尤其是自两院在2013年签署了学术交流与合作谅解备忘录以后，我们更要积极地推动两院开展多种形式的交流与合作，鼓励各自机构研究人员开展多种形式的交流与合作。在此框架下，希望未来两院作为两岸最高科研机构，能够不断充实交流与合作的内容，切实促成一些双方互有合作兴趣的项目，共同提升学术研究水准，共同促进两岸科技创新与融合。 

      此次会议主要议题为：大数据及生物信息学、转化医学及传染病和神经科学。本届论坛报告召集人为中科院前沿科学与教育局局长许瑞明和中研院院士李文雄，共邀请了2个大会报告和34个分会报告。中科院代表团共21人出席会议，包括：陈润生院士、杨子恒院士、李林院士等专家，代表团成员主要来自生物物理所、北京基因组所、动物所、遗传发育所、上海生科院、巴斯德所、上海高研院、广州生物医药与健康研究院和昆明动物所等单位。台湾出席论坛的专家主要来自于中研院生医所、基因体中心、分生所、统计科学所、资讯科学所、化学所、细胞所和台湾大学、清华大学、长庚大学等单位。 

      论坛结束后，中科院代表团参访了中研院分生所、生医所、基因体中心等单位，并赴新竹访问了工业技术研究院和清华大学生命科学院。代表团的到访受到了台湾各接待单位的热烈欢迎，工研院生医所和清大生科院有关主管均纷纷表示希望加强和中科院的往来与合作，特别是在生命科学领域的合作，包括人员交流，项目合作，共同培养学生等。 

       首届海峡两岸生命科学论坛于2012年12月3日至4日在京成功召开。经两院商定，第三届海峡两岸生命科学论坛拟于2016年在大陆举办。